不来梅大学的重点在工程和自然科学领域，最突出的是工业工程，物理学，数学，微生物学，计算机与数字媒体，地球科学（特别是海洋地球科学）和法律（尤其是欧洲法），这些专业享有很高的声誉。不莱梅大学海洋地质专业是德国自然科学基金重点建设科研示范点。全球海洋钻探项目（ODP和IODP）中的三分之一及欧洲区负责的大西洋及北冰洋钻井样品全部存放于不来梅大学。另外两个点及印度洋和太平洋部分，分别在美国和日本。此外，应用辐射技术研究所和海上交通运输与后勤研究所在基础理论研究方面处于领先地位。海运业热带生态研究所和马克斯－普朗克海洋微生物研究所为海洋研究制定新方案。
同时，这里还是阿尔弗雷德－魏格讷极地和海洋研究所的所在地。
